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長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是一類長度超過200nt的長鏈非編碼RNA分子,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,它可在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄後調控等)調控基因的表達,是遺傳學的研究熱點。
LncRNA不只是基因組中的承接序列,另外是承擔了各種DNA、RNA及蛋白間調控性能的重要遺傳信息。想要了解另外LncRNA研究套路,LncRNA與miRNA關系等,可以點擊幹貨文章《LncRNA的生物學調控》察看
1)驗證LncRNA 的表達水平和細胞內亞定位;
2)通過網絡數據庫,預測LncRNA 可能結合的 miRNAs;
3)LncRNA 結合的 miRNAs 的信息學篩選及荧光素酶進一步篩選驗證;
4)miRNA 靶基因預測與性能富集分析;
5)miRNA 靶基因的篩選、驗證及相關性能研究;
6)lncRNA-miRNA-mRNA 調控網絡的驗證。
1)利用專業軟件進行miRNA與lncRNA和靶基因的結合位點預測;
2)采用Promega公司特有psiCHECK質粒;
3)所采用的Luciferase雙荧光報告系統,可以獲得寬泛的線性定量範圍與極高的靈敏度;
4)采用瞬時轉染技藝,操作簡便、快速,周期短,適用於絕大多數細胞類型
1)LncRNA過表達和幹擾質粒構建;
2)LncRNA過表達和幹擾病毒包裝;
3)基於慢病毒技藝的穩定細胞系構建效勞;
4)LncRNA與靶基因競爭結合microRNA驗證效勞
5)ceRNA機製研究效勞
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